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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

最新调查：台湾12月消费者信心指数创逾13年新低******

　　中新社台北12月27日电 台湾“中央大学”台湾经济发展研究中心27日发布12月消费者信心指数(CCI)总指数为59.12点，创下逾13年新低。

　　该中心执行长吴大任就此指出，台湾制造业景气还未落底、劳动市场持续恶化，明年想靠内需撑经济恐怕不乐观。

　　据中央社、联合新闻网等台媒报道，这项调查显示，12月消费者信心指数的6项分项指标中，仅物价水平上升，购买耐久财、经济景气、家庭经济状况、就业机会、投资股市时机等5项指标均下降。

　　其中，“未来半年家庭经济状况”调查指数70.9点，为2010年5月以来最低。“未来半年就业机会”降至61.1点，创下近13年新低。“未来半年购买耐久性财货时机”指数99.9点，由于跌破100点，绝对水平从“偏向乐观”转为“偏向悲观”。

　　对于上述指数的持续下降，吴大任认为，这反映出民众对经济景气信心低迷，对未来家庭所得不乐观。他分析指出，在通胀压力笼罩与全球主要央行持续紧缩等双重压力夹击之下，台湾经济急转直下。大家期望明年可以靠内需支撑经济，抵挡出口衰退，“但这希望要成真，难度非常高”。

　　此次调查由“中央大学”台湾经济发展研究中心主办，调查期间为12月18日至21日，以电话访问方式进行，采电脑随机抽样，共访问2870名台湾地区20岁以上民众，在95%的信心水平下，抽样误差为正负2.0个百分点。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）